皮肤层下面有豆大疙瘩可能是皮下囊肿，也有可能是皮下纤维瘤。可以到专门的皮肤科去做检查的医生的面诊下明确具体的原因。
1、皮下囊肿：皮肤囊肿是因为某些原因导致的真皮皮肤下面形成了囊性的结构增生，肠内组织可能会含有很多的液体或者是其他的物质，可以分为表皮样囊肿、粟丘疹、毛根鞘囊肿等种类。当皮肤上面出现瘙痒，经过抓挠之后有可能会形成皮下囊肿，也有可能是因为基因突变形成的毛囊发育异常形成了囊肿。主要的检查方式就是到医院的皮肤科，通过做病理显微镜检查的方式明确囊肿的类型，没有特殊症状的时候不需要治疗，可以在医生的指导下通过手术切除的方法来治疗。
2、皮下纤维瘤：纤维瘤是一种比较常见的良性组织肿瘤，可能是因为局部的皮肤受到了炎症的刺激，或者是因为身体中的脂肪代谢出现了异常引起的纤维瘤组织。出现皮下纤维瘤的时候，可以到医院去做病理学检查和影像学检查，判断具体的病情，较小的情况下不需要处理，较大的则需要在医生的操作下使用手术切除。