甲硝唑栓后褐色分泌物可能是药物的残留所致，属于正常现象，不用过于担心，该药物具有杀菌消炎的作用，可以用于治疗阴道炎，能够改善阴道瘙痒以及红肿的问题。
甲硝唑栓属于一种阴道用药，使用甲硝唑而来做好阴道给药治疗后，会导致阴道内有褐色分泌物排出，这是正常的生理反应，不用过于担心，主要是在塞阴道药物时，对阴道黏膜或者宫颈的接触部位造成刺激引发，一般出血量和分泌物量都是比较少的，一般恢复一段时间后，症状会有所缓解。另外也有可能是女性已经来到月经的生理周期，导致阴道的分泌物有所增多，通过使用甲硝唑栓能够有效的治疗阴道炎，比如滴虫性阴道炎或外阴阴道假丝酵母菌病。
在使用甲硝唑栓来治疗阴道炎时，最好到专业的妇科医院找经验丰富的医生来做阴道给药的操作，从而降低对宫颈的损伤，以免导致出现接触性出血的现象。使用甲硝唑栓治疗阴道炎期间，要注意做好外阴部位的护理工作，短期内避免同房，引起交叉感染，可能会影响到阴道炎的治疗效果。