包皮上长小水泡可能是出现了生殖器疱疹，还有可能是皮肤过敏或者是龟头炎。
1、生殖器疱疹：生殖器疱疹最主要的表现是包皮上可能会产生水泡，而且还会伴随着高雅的现象，是由于单纯疱疹病毒感染所引起的性传播疾病，容易发生在性生活比较活跃的女性或者男性身上，严重的时候会出现溃烂，需要及时到医院做全面检查，可以口服抗病毒的药物，同时也可以对局部涂抹药物控制病情的发展，还要注意个人卫生，选择宽松透气的衣服。
2、皮肤过敏：如果个人护理不当或者是穿材质不好的内衣，对阴茎局部造成摩擦产生皮肤过敏，也会伴随着肿胀或者疼痛，皮肤上有水泡，要及时到医院进行过敏原检查，同时还要口服抗过敏或者涂抹清凉止痒的药膏。
3、龟头炎：如果包皮过长长时间污垢堆积没有及时清洁，可能也会对龟头的部位造成严重的伤害，容易出现水泡瘙痒，而且还会伴随着恶臭分泌物增多，要通过手术切除或者是使用药物来对局部清洗，促进炎症的消退，要注意小便后用温水清洗。