阴茎上面有小水泡多考虑是阴囊湿疹导致的，也不排除是龟头炎、生殖器疱疹等原因引起的，可以根据引起的原因进行治疗。
1、阴囊湿疹：局部出汗较多、长期生活在潮湿环境中等原因可能诱发该疾病，导致出现阴囊部位丘疹、潮红等症状。可以遵医嘱使用盐酸左氧氟沙星胶囊、炉甘石洗剂等药物辅助改善。
2、龟头炎：可能是包皮过长、清洗频繁等原因引起的，通常会出现龟头皮肤黏膜红斑、溃疡等症状。可以在医生指导下使用红霉素软膏、甲硝唑片等药物缓解。
3、生殖器疱疹：该疾病常常是皮肤损伤、病毒感染等原因引起的，可能会引起生殖器周围水疱、糜烂等症状。可以遵医嘱使用对乙酰氨基酚片、阿昔洛韦乳膏等药物进行治疗。
除此之外，还可能是阴茎炎、假性湿疣、尖锐湿疣等原因造成的，需要及时到正规医院就诊。