男性生殖器囊肿有可能是先天性发育不良、皮脂腺分泌旺盛、皮肤代谢异常等原因引起，需要及时到医院做检查最好选择手术切除治疗。
1、先天性发育不良：胚胎在子宫内生长发育时受到细菌和病毒感染，或者是接触到电子辐射物质，有可能会影响正常的生殖器生长和发育，还会出现生殖器囊肿，会在生殖器部位出现表面光滑和边缘规则的肿块，在囊肿生长比较快时，要及时到医院做检查，然后通过局部囊肿切除手术来治疗。
2、皮脂腺分泌旺盛：皮肤清洁不到位或者是体内激素分泌异常，有可能会出现皮脂腺分泌旺盛，在皮脂腺脱了之后不及时排出，有可能会在毛囊内堆积，随着时间变化会形成生殖器囊肿，还会出现局部有突起的肿块或者是出现疼痛，需要做超声波检查或者CT扫描来判断病情，在影响到生殖器健康时，需要做微创手术切除。
3、皮肤代谢异常：生殖器部位皮肤代谢异常之后有可能会出现有凸起的囊性肿块，还会影响生殖器功能，囊肿体积比较小，不需要做特殊治疗，需要定时到医院做复查来判断生长情况。