阴茎根部长肉粒可能是因为毛囊炎、阴囊湿疹、尖锐湿疣等原因所导致的，需要采取药物治疗。
1、毛囊炎：通常是一种毛囊炎症性皮肤病，主要表现为毛囊周围出现丘疹，如果发生在阴茎根部，就有可能会导致局部长肉。通常可以在医生指导下使用红霉素软膏、夫西地酸乳膏、莫匹罗星软膏涂抹，能够促进炎症消退，帮助恢复。
2、阴囊湿疹：通常是比较常见的一种湿疹，主要发生在阴囊周围的丘疹，会导致局部长小颗粒，并且还伴有瘙痒症状。通常可以在医生指导下使用丁酸氢化可的松乳膏、地塞米松乳膏、卤米松乳膏等药物进行治疗。
3、尖锐湿疣：通常是因为病毒感染所引起的主要表现为生殖器周围丘疹，所以会出现阴茎根部长小肉粒。一般可以在医生指导下使用氟尿嘧啶乳膏、鬼臼毒素软膏、咪喹莫特乳膏等药物进行治疗，病情严重时可以采取激光或者是冷冻等方式进行治疗。
除此之外，也有可能是阴性外出导致的，需要及时采取相应治疗措施。