蹲时间长膝盖疼的厉害有可能是生理性或是病理性原因，要根据原因针对性治疗。
1、生理性原因：长时间蹲着有可能会导致膝盖不会受到压迫，还可能会导致局部出现血液供应缺乏，有可能会导致膝盖不会出现麻木和无力，还可能会引起疼痛等多种的不良症状。一般可以通过按摩热敷的方式缓解，有利于促进血液流通和缓解疼痛症状，有利于身体逐渐的恢复正常。
2、病理性原因：有可能是出现了关节炎或是滑膜炎，也可能是出现了下肢软组织损伤等原因引起，蹲的时间较长很可能会导致局部的膝盖功能受到影响，还可能会导致膝盖不会出现疼痛和引起活动不便等多种的不良症状。一般可以在医生指导下使用布洛芬颗粒和双氯芬酸缓释片药物治疗，可以起到消炎镇痛的作用，有利于炎症消除和积液消退，还有利于促进局部的软组织损伤好，达到良好的治疗效果，使疼痛逐渐的减轻和消退。
平时要避免长时间蹲着，以免导致膝盖部位的压力增加和防止疼痛反复发作，药物治疗期间通常要减少活动量，多注意休息。