吃益生菌拉肚子可能与腹部受凉、服用过量、饮食不规律等原因有关，具体情况可到医院进行相关咨询。
1、腹部受凉：没有及时增减衣物，吃生冷刺激的食物，可能会导致腹部受凉，出现上述症状，需要在医生指导下，通过热水袋热敷的方法来帮助缓解。
2、服用过量：当服用益生菌剂量过大时，由于肠道系统未完全适应出现的肠道应激反应，可能会出现上述症状，一般在调整药物后就能够得到改善、
3、饮食不规律：当服用益生菌时，如平时饮食不规律，不注意饮食卫生可能会造成出现上述症状，在医生指导下使用益生菌、蒙脱石散等药物治疗。
除上述病因以外有可能是肠胃疾病导致，应该到医院检查，然后针对性的治疗。