颅磁刺激仪通常情况下可以治疗自闭症，对于病情的恢复有一定帮助，在治疗的过程当中，同时也需要配合心理治疗的方法来辅助治疗。
自闭症的患者会造成自身的脑部神经活性出现下降，甚至脑部结构也会出现不正常的情况，从而对正常的生活以及工作造成很大的影响，选择颅磁刺激仪以后，可以通过利用脉冲磁场，能够有效的作用于中枢神经系统，也会产生感应电流，改变皮层神经细胞，从而引起患者出现生理生化反应。
自闭症的患者在治疗期间，同时也应该配合使用抗精神病以及抗抑郁的药物来进行治疗，这样能够有效的缓解症状，及时的进行干预训练，促进患儿身体发育，同时也可以防止疾病减少不良的行为，促进生活质量，家长应该抽出更多的时间来陪伴患者，及时的鼓励患者，自主完善日常的活动，督促进行生活自理以及社交等技能的训练，同时饮食上也可以多吃一些含有维生素比较丰富的水果和蔬菜，这样能够补充身体所需要的一些营养成分，从而提高自身的免疫力。