甲型流感病毒是根据病毒感染表层的红细胞凝集素（H）和神经氨酸酶（N）来取名，在其中H有16个亚型，N有9个亚型。H5N6禽流感是禽流感病毒的一种亚型。
2017年11月17日，日本全罗道一家养鸭场出现H5N6亚型高高致病禽流感。该大农场有大概12000只家鸭，全部的家鸭过后都被屠宰。
H5N6禽流感病毒于2014年5月南充市在检验1例重症肺炎病案咽拭子标本采集时，检验出H5N6禽流感病毒核酸阳型，经我国疾病防治监测中心进一步检验明确为H5N6禽流感病毒。
2014年5月，H5N6禽流感病毒病案是一名49岁的男士病人，有病亡禽畜触碰史，住在南充市南部县，疾病诊断为亚急性重症肺炎，由省、市协同专家团全力以赴医治无效身亡。
2014年12月22日，广东省卫生计委从1例重症肺炎病案中检验出H5N6禽流感病毒核酸阳型，我国疾病防治监测中心进一步核查检验結果为甲型H5N6禽流感病毒核酸阳型。病人为男士，58岁，现居广州广州番禺区，曾于2013年开展结肠癌手术，现阶段病况危重症，在广州的定点医疗机构收治病人住院治疗。1月中下旬，该病人被取得成功救护，转到一般医院病房。1月30日，全世界第一例H5N6流感活物病案取得成功救护情况报告会在广医一院举办。钟南山在大会上强调，检验发觉H5N6病毒感染聚合酶627位点突变，非常容易感染人类；第一例取得成功救护个例确认，新型病毒要是尽早用奥司他韦等抗病毒治疗，病案能冶疗可救。