芽孢杆菌用于增强抵抗力、抑制细菌繁殖、维持肠道平衡等功效，芽孢杆菌对身体有一定的好处，是身体里面的一种正常细菌，能用于抑制其他病菌的生长，同时还可以刺激免疫器官的分泌，达到增强自身抵抗力的效果，通常情况下副作用较小，不会在身体里面产生明显的残留，能产生芽胞的链球菌或革兰阴性杆菌。
1.增强抵抗力：芽孢杆菌包括芽孢杆菌属、芽孢乳杆菌属、梭菌属、脱硫肠状菌属和芽孢八叠球菌属等，通常情况下，在增殖的过程当中会释放高活性的分解酶，能起到增强自身抵抗力的效果。
2.抑制细菌繁殖：芽孢杆菌能起到比较好的抑制细菌繁殖效果，一般可以把难降解的大分子物质分解成可用的小分子物质，达到抑制有害细菌病原体等微生物生长的优点，可以用于改善肠道的环境。
3.维持肠道平衡：芽孢杆菌一般情况下能用于维持人体的肠道平衡，可以促进食物的消化和吸收。通常是用于肠炎，当患者有腹部疼痛腹胀等临床的症状，都可以在医生的指导下通过使用芽孢杆菌进行缓解。