肛门有个软软的肉疙瘩一般是痔疮、肛门息肉、肛周脓肿等引起的，需要到医院检查之后明确原因才可以对症治疗。
1、痔疮：如果长时间蹲厕所或长时间坐着工作，很可能会导致痔疮，在痔疮发生的时候会导致肛门部位在排便时有一个肉球经过医生做诊断之后可以选择微创手术治疗。
2、肛门息肉：肛门部位长时间受到刺激后，很可能会引起炎症，性增生也会形成息肉组织，导致肛门部位有一个软软的肉疙瘩，也需要选择手术方式去除后才可以恢复。
3、肛周脓肿：没有做好肛门部位清洁卫生，长时间受到感染后刺激会形成脓肿，也会有疼痛感，需要选择做切开引流治疗。
除了以上原因之外，还有可能是直肠脱垂或肿瘤，要根据病因做医治。