跑步耳朵疼可能是运动过程中一些不健康的运动习惯引起的，也可能是跑步者本来患有耳部疾病。
1、平时不锻炼的人，突然开始跑不了，身体各个器官一时都无法适应，可能就会出现耳朵疼的情况。
2、运动量过大了，有的人在跑步时喜欢挑战自己的极限，可是殊不知运动量过大会超出身体原有负荷，可能会压迫到耳后的神经，从而导致耳朵疼。
3、缺氧引起的，在跑步时有的人会出现呼吸急促的情况，感觉要喘不过来气，那就是缺氧了。
4、耳朵进风引起的，当一个人跑步的速度较快的时候是有可能导致风吹进耳朵的。
5、一些本身患有中耳炎还有咽炎等疾病的人群，跑步也会引起耳朵疼。
跑步耳朵疼是怎么办
1、两手掌相搓，使互相产生热，然后按于两耳，掌心对准耳道，四指贴于枕后，作缓慢的重按，缓慢放开(注意放松时要和缓以免内耳痛)3次，如此为1遍，共5遍。此手法也是通过改变耳道内压力给予中耳一定的良性刺激，对低音调耳鸣具有良好的治疗作用。
2、以拇指与食指指面同时捻揉两耳轮及耳垂，从上向下共揉捻3分钟，令两耳发热为度。耳轮和耳垂上有很多穴位和神经反射点，轻柔地捻揉使这些穴位反射点得到良性的刺激，有助于耳内环境的改善，促进中耳炎症的消除和辅助内耳神经功能的保持。
3、用食指在前、拇指在后贴于前后耳根部，共揉3分钟，以耳根透热为度。此手法能有效提高耳内血液循环，特别是针对内耳缺血引起的高音耳鸣能够起到良好的治疗作用。