流感嗜血杆菌首选药物并不能完全确定，需要根据个人症状以及体质不同，所以药物也会存在一定的差异。可以选择祛痰镇咳的药物，也可以选择青霉素、红霉素、头孢噻肟药物治疗。
1、去痰镇咳：如果流感嗜血杆菌侵入到肺部组织出现了肺部炎症，伴随着剧烈性的咳嗽以及咳痰症状，可以选择甘草肺力咳药物，或者是枇杷止咳露，有助于化痰镇咳，帮助症状得到改善。
2、青霉素：青霉素药物是一种明显的消炎药物，破坏细菌细胞壁，是细胞繁殖达到良好的杀菌效果，属于比较常见的抗生素药物，可以增强人体抵抗疾病的能力，对于流感嗜血杆菌引起的疾病会有治疗效果。
3、红霉素：通常包括罗红霉素、阿奇霉素，属于大环内酯类的抗生素药物，不仅可以治疗流感嗜血杆菌，还能够帮助溶血性链球菌引起的急性扁桃体炎或者是鼻窦炎症状得到改善，还能帮助肺炎沙眼衣原体感染症状缓解。
4、头孢噻肟：是一种广谱的抗生素药物，对于流感杆菌、大肠杆菌等疾病有较好的治疗作用，可以减少细菌繁殖。