肛窦炎需要在医生指导下口服阿奇霉素、阿莫西林、左氧氟沙星的药物来治疗，还需要到医院进行相关检查。
1、阿奇霉素：阿奇霉素一般是属于大环内酯类的抗生素对于沙眼衣原体以及敏感淋球菌有抗菌活性的效果。
2、阿莫西林：患者还可以在医生的指导下口服阿莫西林的药物来治疗，一般是属于广谱青霉素类的药物，可以达到杀菌的作用，还可以加速炎症消退。
3、左氧氟沙星：属于喹诺酮类药物，对于患者出现的金黄色葡萄球菌或者是沙门菌，有良好的抗菌活性的作用，有利于病情恢复。
在使用药物期间还要随时观察身体状况，如果有不适的症状应该立即就医治疗。