大便完肛门不舒服的原因可能是肛周湿疹、肛裂、痔疮等因素所导致。
1、肛周湿疹：在受到过敏原刺激之后，就有可能会导致肛周湿疹的症状，也会导致局部出现很多的小红疙瘩，并伴有剧烈的瘙痒感。可以在医生指导下通过使用曲安奈德益康唑乳膏、他克莫司软膏等药膏涂抹。
2、肛裂：大便如果比较干燥的情况下，在排大便的过程中，就有可能会对肛门组织造成损伤，也可能会引起肛裂，会导致局部出现肿胀感和疼痛感。可以通过使用红霉素软膏、莫匹罗唑软膏、他克莫司软膏等药膏涂抹。
3、痔疮：在出现痔疮之后也有可能会导致排便不畅和肛门有不舒服的感觉，也会导致肛门肿胀和肛门疼痛。可以通过痔疮切除手术等方法来做治疗。
除了以上原因也不排除是肛瘘等疾病所致，还需要到医院做详细的检查，及时了解病情原因之后对症治疗。