一、保持局部清洁，避免刺激，防止继发感染。局部可用1/5000高锰酸钾液浸洗并敷消炎软膏。
缺点：不能根本消除病因，作为辅助治疗手段。
二、针对不同病原体，采用抗真菌、抗滴虫等药物治疗；若感染明显，发热和淋巴结肿大，可全身应用抗生素；过敏性因素引起者，可外用皮质类固醇激素制剂。
缺点：长期使用易产生副作用，如胃肠道反应，肝肾毒性等。
三、如因包茎或包皮水肿不能翻转浸洗、引流不畅，经一般治疗炎症仍不能消退时，可行包皮背切开术，以利引流。待炎症完全消退后再行包皮环切术。
一般龟头炎多考虑为真菌感染，长期慢性炎症刺激而引起上皮细胞脱落，而出现分泌物的症状。首先建议每日清洗生殖器，保持局部卫生，避免饮酒劳累，熬夜的现象，要检查上面的细胞学，做细菌培养，加药敏试验，就可以有针对性的用药了。
龟头炎的情况一般是因为长时间熬夜和劳累等原因引起的上火，包皮垢存留刺激引起的。建议注意休息，避免熬夜和劳累，不要吃辛辣刺激性过大的食物，不要喝酒，饮食以清淡营养易消化为主，穿比较宽松的棉质内衣裤，避免长时间坐着，局部使用莫匹罗星软膏涂抹治疗。
如诊断为龟头炎，可应用1：5000高锰酸钾溶液浸洗，外涂红霉素软膏治疗，以及可服用头孢菌素类等药物，如为念珠菌感染，可外涂克霉唑软膏治疗，保持局部清洁卫生，如有包皮过长，可在感染控制后手术治疗。