厌氧菌感染并没有首选药，可以使用甲硝唑胶囊、盐酸林可霉素胶囊、地衣芽孢杆菌活菌胶囊等药物治疗，需要遵从医生指导用药。
1、甲硝唑胶囊：地面包含的主要成分是甲硝唑，属于一种抗生素药物，对大多数的厌氧菌具有强大的抗炎作用。
2、盐酸林可霉素胶囊：主要适合于敏感葡萄球菌以及厌氧菌所引起的上呼吸道感染或者是皮肤软组织感染，能够抑制细菌蛋白质的合成，达到抗菌作用。
3、地衣芽孢杆菌活菌胶囊：通常能够帮助调理肠道菌群，对于厌氧菌感染引起的肠道功能紊乱，能够起到辅助的作用。
除此之外，也可以使用盐酸克林霉素胶囊、替硝唑胶囊或者是注射用盐酸氟霉素等药物治疗，需要按照医生嘱咐的疗程以及用量使用，用药期间还要注意合理饮食。