月经结束左侧附件疼可能是左侧附件炎、盆腔炎、附件囊肿等因素导致的，要明确原因对症治疗。
1、左侧附件炎：在月经的时候如果不注意个人卫生，容易导致病原体进入阴道，发生逆行感染，从而会引起左侧附件炎，表现为左下腹部疼痛、下坠或伴右左侧腰部酸痛，从而引起左侧附件疼。可以在医生指导下服用甲硝唑片、替硝唑片、桂枝茯苓胶囊等药物治疗。
2、盆腔炎：由于月经时不注意个人卫生或进行性生活会导致病原体侵入生殖器官，从而会引起盆腔炎，容易出现白带异常、腰痛、月经失常，而且还会引起左侧附件隐隐作痛。需要在医生指导下服用阿莫西林霉素片、盐酸左氧氟沙星片、氧氟沙星胶囊等药物治疗。
3、附件囊肿：附件囊肿可能是感染、激素等因素导致的，表现为一侧小腹部隐隐作痛、腹部胀满感觉感，它可能会出现异常阴道出血、月经失调等改变。如果难度比较大，需要通过手术治疗，比如开腹手术、经腹腔镜手术。
除了以上原因也可能与左侧子宫附件肿瘤有关，具体原因需要到医院就诊检查，然后进行针对性治疗。