小儿牛黄清心散在医生的指导下，严格的应用药物是不会引起副作用的，但盲目的用药可能会出现恶心，呕吐，腹痛，腹泻等不良的现象，还有部分小儿还可能会出现皮肤、红肿、瘙痒以及有丘疹的现象，需要引起重视。
小儿牛黄清心散属于临床上比较常见的一种中成药，主要的成分是山药，牛黄，黄芪，当归等，一般可以起到清心化痰以及镇静祛风的功效，对缓解出现的言语不清，头晕目眩以及神志混乱有一定的帮助作用。
由于小儿的胃肠道发育还不够成熟，在应用药物后可能会对胃肠造成刺激，出现腹痛腹泻的现象，也可能会对肝脏或肾脏造成一定影响，需要在医生指导下严格应用。