随着各种电子产品的流行，现在患上眼病疾病的人越来越多了，尤其是近视眼、眼干症和眼睛疲劳都是比较常见的眼病疾病，当出现这些眼病问题之后，除了要采取让眼睛适当休息之外，很多人还会想到用眼药水缓解眼部的这些问题，如果长期的使用眼药水就会有一些副作用，在使用眼药水之前是需要了解的。
一、心血管系统
拟交感神经药物如新福林。常用于滴眼散瞳检查眼底。有人报告，33例用10%新福林液滴眼后产生严重反应，共中15例心肌梗塞(11例死亡)，还有7例需要进行心脏复苏抢救。同一作者报告，用2.5%新福林液滴眼后，未再发生心肌梗塞患者。也有人报告应用10%新福林液滴眼后，发生严重高血压，其中1例并发蜘蛛膜下腔出血。Kim等人报告，交感神经部分失去功能的患者(例如循尿病性的植物神经系统病变或长期接受利血平或呱乙咤治疗的患者)对新福林更敏感。Adler等人报告I例糖尿病患者用10%新福林液滴眼后，引起冠状动脉痉挛。用1%或2.5%新福林液滴眼也可发生高血压，但危险性较小。
二、呼吸系统
噻吗心安是一种非特异性β肾上腺能阻滞剂，制成眼药水用于治疗原发性开角型青光眼，可以产生严重的心肺系统和神经系统反应，Cha-ran等人报告1例无症状的哮喘患者，用唾吗心安滴眼后，发生急性支气管痉挛，第二次再给患者试点2滴0.5%噻吗心安后，其第一秒时间肺活量(FEV)降低25%,再试点4滴后，FEV降低47%。也有人报告过1例老年风湿性患者用噻吗心安眼药水后，发生充血性心力衰竭。
三、植物神经系统
眼药水也可以引起植物神经系统严重的反应。胆碱能药物如毛果芸香碱可引起毒性反应，但抗胆碱醋酶制剂如碘化磷酞硫胆碱、地美卡林(demecarium)眼药水的副作用更为严重。
局部应用毛果芸香碱过量后，可以产生副作用，如恶心、呕吐、腹肌痉挛、腹泻、出汗、流涎、流鼻涕、呼吸困难、全身无力。局部低剂量毛果芸香碱也可以引起胃肠道痉挛，但停药24小时后，症状即可消失。
四、中枢神经系统
在应用抗胆碱能药物时，如用阿托品滴眼，特别在儿童常可出现思维紊乱、幻觉、动作不稳、烦躁、失眠;曾有报告在婴儿可引起抽搐、高烧、昏迷甚至死亡。阿托品滴眼后，最常见的是面部潮红、口干、体温升高和容易激动。东蓖若碱可能引起同样的症状，也可以引起激动、思维紊乱和幻觉。在所有抗胆碱能药物中，盐酸环戊通((CyC10-pentolatehydrochloride)可能最容易引起中枢神经系统毒性反应，更常见于儿童。此外，在老年人可加重已有的精神症状。
五、其他毒性反应。
曾有人报告长期应用氯霉素眼药水引起骨髓抑制，也曾报告发生再生障碍性贫血。长期用皮质激素滴眼的患者，血浆皮质醇的水平可降低50%以上。有人报告1例4岁女童，长期用地塞米松滴眼后发生库兴氏综合征;国内郭俊德川曾报告1例引起水肿、皮疹的过敏反应。