1、清热解毒
板蓝根具有抗细菌内毒素的作用。细菌内毒素就是中医所说的“热毒”，主要是为细菌被杀死后所释放出的毒素。研究发现，板蓝根中含有的有机酸、生物碱、核苷等多种类型化学成分，能够直接中和、降解内毒素或破坏细菌内毒素的正常结构，同时抑制内毒素诱导的炎症介质合成与过度释放。板蓝根具有抗氧自由基、增强免疫力的功效。
2、抗菌抗病毒
板蓝根对多种细菌起到杀菌作用。板蓝根水浸液对枯草杆菌、金黄色葡萄球菌，八联球菌、大肠杆菌、伤寒杆菌、副伤寒甲杆菌、痢疾(志贺氏、弗氏)杆菌、肠炎杆菌等都有抑制作用;丙酮浸出液也有类似作用，且对溶血链球菌有效(皆用琼脂小孔平板法)。对A型脑膜炎球菌之抑菌作用与大蒜、金银花相似。对流感病毒PR8株和京科68-1株有明显抑制作用。在试管内板蓝根有杀灭钩端螺旋体的作用。