肾囊肿患者在积极治疗的同时还应该注意饮食，控制蛋白质对于减轻肾脏负担，减少末期肾功能不全、毒症毒素的产生，缓解病情均起着重要的作用。在控制蛋白质的摄入和油腻的食物的同时，另外腌制类、辛辣刺激类及霉烂变质的食物也不要吃。
肾囊肿的饮食需要坚持一定的原则性：
1、蛋白质的控制：现代医学认为，蛋白质摄入过低或过多，对肾脏都无益处。尤其是大量摄入蛋白质后，可产生过多的代谢产物，如末期肾功能不全、毒症毒素中尿素、肌酐、胍类、多胺和某些中分子物质基本上都是氮质的代谢产物。控制蛋白质对于减轻肾脏负担，减少末期肾功能不全、毒症毒素的产生，缓解病情均起着重要的作用。
2、食盐摄入的限制：根据患者病情和肾功能受损程度控制食盐，但并非所有的慢性肾功能不全患者都要严格限盐。
3、水的摄入：单纯性肾囊肿时，由于肾脏浓缩功能下降，体内代谢产物需要较多的水分才能从肾脏排出，因此，单纯性肾囊肿患者如无明显的浮肿、心衰、高血压时，不应盲目限水。
在控制蛋白质的摄入和油腻的食物的同时，另外腌制类、辛辣刺激类及霉烂变质的食物也不要吃。因为肾脏有病时一般情况下会出现浮肿的症状，所以有大多数病人就盲目的限制水的摄入，虽然肾囊肿病人肾的浓缩功能下降，但是如果病人没有出现显然的浮肿、心衰和高血压时，不要盲目的限水，若过分限水反而会加重肾功能的恶化。食盐的摄入要根据病人的病情及肾功能损害的程度作调整，并不是所有的肾病病人都要限制盐类的摄入。
囊肾的病人在选择优质蛋白的食物的同时，日常起居注意休息，避免剧烈的体力活动，以防导致肾囊肿破裂。