喝咖啡腹泻可能是胃肠刺激、过敏也不排除是自身患有慢性胃肠炎导致的，需要鉴别诊断后治疗。
1、胃肠刺激：咖啡当中含有较多的咖啡因成分，如果在空腹的状态下饮用，可能会对胃肠道造成刺激性，导致胃肠受损引起腹泻的现象。建议在喝咖啡时控制饮用咖啡的量，也应避免空腹状态下饮用。
2、过敏：如果本身属于过敏性体质，对咖啡豆存在过敏的情况，在喝咖啡后有可能会出现腹泻的现象。需要在医生指导下，通过口服盐酸苯海拉明片、氯雷他定片等药物改善。
3、慢性胃肠炎：如果患者本身存在慢性胃肠炎，在喝咖啡后可能会对肠黏膜造成刺激，进而出现腹泻。需要在医生的指导下通过口服蒙脱石混悬液或赖氨葡锌颗粒等药物改善。
除此之外，喝咖啡腹泻也不排除是肠易激综合征导致的，需要鉴别诊断后治疗。