阿托品的临床应用解除平滑肌痉挛、麻醉前给药，也可以用于缓慢型的心律失常以及眼科等。
1、解除平滑肌痉挛：解除平滑肌痉挛，通常适用于各种内脏部位出现的绞痛，包括膀胱刺激症以及胃肠绞痛，比如出现的尿频和尿急症状，能得到改善，也可以缓解肾绞痛以及胆绞痛症状，通过用阿托品治疗遗尿症，也属于是一种比较好的方法，可以利用其松弛膀胱泌尿机的作用帮助症状改善。
2、麻醉前给药；自制腺体分泌的时候可以用于全身麻醉前给药能防止分泌物堵塞呼吸道，从而可以减少呼吸道的分泌物，同时能减少吸入性肺炎的症状发生，对于严重性盗汗时也可以得到缓解。
3、缓慢型的心律失常：缓慢型的心律失常，在使用了阿托品之后，可以治疗鼻子神经过度兴奋所产生的房室阻滞以及窦房阻滞等，也可以用于治疗继发性的窦房结功能低下。
4、眼科：在平时检查眼底的时候，用阿托品溶液的滴眼液病症能得到改善，验光佩戴眼镜的时候，也需要通过用阿托品，能让睫状肌的调节功能得到充分的麻痹，可以让晶状体固定。