从归类上而言，阿莫西林胶囊归属于青霉素类，是一种β内酰胺抗炎药；头孢克肟是一类抗生素，关键有四代，第一代有头孢唑林、头孢拉定、头孢氨苄，二代、三代、四代各不相同的象征性药品。
从抗菌谱上而言，青霉素类非常是阿莫西林胶囊，能够对革兰氏阳性菌有比较好的医治功效；头孢克肟从一代到四代，对革兰氏阳性菌的抑菌功效慢慢变弱，可是对革兰氏阳性菌阴性菌的功效慢慢提高。从过敏症状上而言，阿莫西林胶囊归属于青霉素类，较为非常容易造成过敏症状，因此针对青霉素类皮肤过敏的人不适合应用；头孢的药品过敏症状相对性较少，可是存有青霉素类皮肤过敏或是头孢类药物高敏体质的患者是不适合应用的，主要是因为头孢类药物和青霉素存有交叉式过敏症状。
从二种药品功效的目标而言，阿莫西林胶囊较为合适于呼吸系统、泌尿、生殖系统的感染，除菌力好，毒副作用较为小，孕妇及其少年儿童应用比较安全性；头孢菌素药品抗菌谱较为广，抑菌功效强，毒副作用也较为低，较为适用呼吸系统、皮肤软组织感染、泌尿生殖系统感染这些疾病的治疗。
头孢克肟和阿莫西林胶囊都归属于青霉素类的β-内酰胺抗炎药。头孢克肟是一大抗炎药的通称，分成一代到四代，从一代到四代对革兰呈阳性革兰阴性杆菌的破坏力慢慢变弱，对革兰呈阴性链球菌的破坏力慢慢提高。阿莫西林胶囊是一种广谱性的青霉素类的抗生素，它对革兰阳性菌的破坏力会更强一些。阿莫西林胶囊临床医学上多是应用内服中药制剂，能够医治呼吸系统、泌尿系统等病菌感染。头孢的抗生素内服和静脉中药制剂都是有，普遍地运用于呼吸系统、泌尿生殖系统及全身别的各系统的抗感染医治中。