人工麝香和天然麝香的区别可能是形成的方式不同，而且香味或者是药物的功效也会不一样，服用的时候一般需要在医生指导下。
1、形成的方式不同：天然麝香主要是由于天然所形成的，而人工麝香主要是由于人工所组成的，可能当中还要较多的杂质。
2、香味不同：天然麝香的香味和纯度相对来说比较高，可能会散发出更香的味道，属于一种中草药的味道，而人工麝香可能会有一种刺鼻的味道。
3、作用不同：天然麝香可能在治疗一些疾病，药效会更加的明显，具有较强的强心或者抗菌消炎的效果，能够促进身体中的炎症快速消失，使病情快速恢复。人工麝香的效果可能没有天然的效果好。
除以上几种之外，通常还有里面的成分不同、针对疾病不同、价格不同的等原因，要遵医嘱选择。