手术后发烧39度一般是不正常的。手术后发烧通常要明确手术类型，如果是无菌手术，通常是由于术后感染引起的，需要遵医嘱服用药物治疗，如果是污染手术，一般会出现发热情况，可能是由于体内炎症造成的，只是发烧39度通常是不正常的，需要通过药物降温。
手术后多数会由于创面刺激导致吸收热，多数会出现发热情况，如果手术后发烧39度多数是不正常的，相对比较严重，需要通过退热治疗。首先要用温水擦洗腋下以及腹股沟等部位进行物理降温，并且要多喝温开水有助于加速身体新陈代谢，如果温度没有明显改变，要及时服用药物治疗。手术后发烧39度，如果是无菌手术，一般要明确发烧原因，查找是否由于各种管道感染或是伤口部位出现感染因素，如果是感染引起的，要及早服用抗生素类药物治疗，比如妥布霉素、克拉霉素等，如果是污染手术，多数会出现创伤后发热，只是发烧39度属于异常情况，通常要通过消炎药物治疗，比如头孢克洛、庆大霉素等。
在做完手术后要注意休息，避免劳累，另外要调整饮食结构，以少量多次为主。