指甲上有凹陷小坑可能是缺乏微量元素、炎症感染、银屑病等引起，还需要做进一步的检查，帮助确诊。
1、缺乏微量元素：指甲上有凹陷小坑可能是由于缺乏微量元素所引起比重，有可能是缺钙或者缺乏维生素后所导致的，到正规医院做微量元素的检测，如果存在缺乏问题要及时的补充。
2、炎症感染：指甲上有凹陷小坑也有可能是因为长时间致病菌微生物的感染所引起，可以使用碘伏消毒处理，同时在医生指导下涂抹抗生素药膏治疗，比如红霉素软膏、莫匹罗星软膏、夫西地酸乳膏等。
3、银屑病：由于银屑病侵入指甲甲板后也有可能会引起凹陷小坑，比较严重者还有可能会出现甲床增厚、指甲剥离等，在医生指导下给予抗生素药物治疗，比如头孢克肟分散片、头孢拉定颗粒、阿莫西林胶囊等。