阴茎上长小疙瘩可能是毛囊炎所引起的，也可能是尖锐湿疣所导致的，另外也不排除龟头炎的可能性，一般可以通过药物治疗或者是激光治疗、冷冻治疗。
1、毛囊炎：主要和长时间不注意局部卫生护理有一定的关系，另外也不排除炎症感染的可能性，在发病期间头脑会出现局部丘疹，而且还会伴随着红肿和疼痛，随着病情的发展可能会出现糜烂。一般需要配合医生使用抗生素药物治疗，这样能够加快炎症的吸收和消退。
2、尖锐湿疣：尖锐湿疣主要是不洁净的性生活所引起的，也可能是受到病毒感染所导致的，主要会导致局部出现疙瘩，而且还会伴随着疼痛的症状，一般需要通过激光或者是冷冻的方法来达到改善的效果。
3、龟头炎：这是属于一种比较常见的男科疾病，在发病期间通常会出现龟头部位红肿或者是疼痛，随着病情的发展可能会出现疙瘩或者是脓性分泌物，需要通过使用消炎药物治疗，可以通过口服药物或者是外用涂抹药物。
恢复期间一定要注意好局部的卫生护理工作，多穿宽松或者是透气性比较好的内裤，保持局部的干燥性或者是透气性。