两个月宝宝耳朵有臭味有可能是中耳炎引起的，也有可能是湿疹导致的，还有可能是不注意耳道清洁卫生造成的，可以根据个人情况对症处理。
1、中耳炎：如果在给宝宝洗澡时，水不小心流到耳朵里，通常会导致耳道发炎，从而引发急性中耳炎或慢性中耳炎，患上中耳炎后会导致耳朵有臭味，并且还会出现耳道分泌物增多情况，可以按照医生的指导服用消炎药物治疗，比如可以服用阿奇霉素、青霉素V钾片、阿莫西林等药物，有利于促进炎症消退，待炎症消退后宝宝耳朵有臭味也会慢慢好转。
2、湿疹：若宝宝属于易过敏体质，接触刺激性物体时，可能会产生过敏反应，若脸部或耳后出现了湿疹，通常会蔓延到耳道，从而使耳朵里面有臭味，可以外用碘伏消毒，并且还可以口服头孢拉定胶囊治疗，同时还应避免接触过敏原，从而改善不适症状。
3、不注意耳道清洁卫生：两个月宝宝还小肠胃功能还没有发育完善，在吃奶时可能会出现溢奶情况，乳汁进入耳道后，可能会导致耳道分泌物增多，甚至还会出现耳朵有臭味症状，可以使用温水清洗局部，有利于缓解耳朵有臭味现象。