食用菌菌种就是指子实体粗大、可供服用的蕈菌（大型真菌），统称为菌类。我国己知的食用菌菌种有350多种多样，在其中多属担子菌亚门。普遍的食用菌菌种有：平菇、草菇、菌类、黑木耳、白木耳、猴头、竹荪、松蘑菇（松茸）、蘑菇、红菇、虫草、冬虫夏草、松露、白灵菇和牛肝菌等；极少数归属于子囊菌亚门，在其中有：羊肚菌、鞍子菌、块菌等。
所述细菌各自生长发育在不一样的地域、不一样的生态环境保护中。
1．食用菌菌种可供人类服用的大型真菌。具体地说食用菌菌种是能够服用的蕈菌；蕈菌，就是指能产生大中型的肉质地（或胶原纤维）子实体或菌核类组织并能供大家服用或药用价值的一类大型真菌。
全世界已被叙述的细菌达12万余种，能产生大中型子实体或菌核组织的达6000多种，可供服用的有2000多种，能大规模人工服务种植的只能40～50种。食用菌菌种在归类上归属于菌物介细菌门，绝大部分归属于担子菌亚门（如香菇、平菇），极少数归属于子囊菌亚门（如羊肚菌）。中国食用菌資源十分丰富多彩，据卯晓岚（1988）统计分析，我国己知的食用菌菌种约657种，他们分归属于41个科、132个属，在其中担子菌620种（占94.4%），子囊菌39种（占5.6%）。2000年统计分析我国的食用菌菌种达938种，人工服务种植的50多种。
八十年代前期至今，食用菌种植作为一项小投资、周期时间短、效果好的赚钱好项目在我国足以飞速发展，食用菌菌种商品曾一度紧俏，售价颇丰。食用菌菌种产业链是一项集经济收益、环境效益和社会经济效益于一体的稳准狠农村集体经济发展趋势新项目，食用菌菌种也是一类有机化学、营养成分、健康保健的翠绿色食品。发展趋势食用菌菌种产业链合乎大家消費增长和农牧业可持续发展趋势的需要，是农户快速赚钱的重要途径。一些國家还完工了年产量鲜菇百吨以上的菇厂，还发展趋势了既供欣赏又供食品的家中种菇和用菌丝液體发醇生产食品防腐剂的技术性21新世纪食用菌菌种将发展趋势变成人类关键的蛋白食品之一2005年中国食用菌的总产值达1200万吨级，居世界第一，据相关网站调查分析，2010年中国食用菌的总产值达2000万吨级，占全球70%。