寻常疣在发作之前是会破坏掉自己原本健康的皮肤，使得自己的皮肤表层产生非常多的水泡和皮疹，而且等病情到了一定阶段以后就会发现自己的皮肤变得更加糟糕，还会产生瘙痒和疼痛交替进行的症状表现，这种情况下就只能是采取全身性的治疗才可以让自己的病情控制住，防止一再加重。
治疗以破坏疣体、调节局部皮肤生长、刺激局部或全身免疫反应为主要手段，包括全身治疗和局部治疗。
1.全身治疗
(1)中医中药如平肝活血方、治疣汤、马齿苋合剂、板蓝根注射液、柴胡注射液等。
(2)干扰素对多发性且顽固难治的疣，可配合全身或病损局部注射干扰素，单独用干扰素疗效不肯定。
2.局部药物治疗
由于多数疣患者在发病1～2年内能自行消退，不少患者即使采用深度破坏性治疗方法，有1/3疣仍会复发，因此对疣的各种局部治疗的疗效估价应特别慎重，对一些能造成永久性瘢痕的方法不宜使用。
(1)氟尿嘧啶(5-FU)有一定疗效。可能出现的不良反应有局部疼痛、皲裂、水肿、过敏反应、流泪、色素沉着及化脓等。
(2)博来霉素皮损内注射每周一次，通常2～3次后疣体脱落，副作用少。
(3)0.7%斑螯素加入等量火胶棉及醋酮溶液中，外用治疗甲周寻常疣，隔日涂搽一次，有一定疗效。
(4)0.1%～0.3%维A酸酒精溶液局部外用，每天1～2次，副作用有局部轻度烧灼感、红肿、脱屑及色素沉着。
(5)3%酞丁胺软膏或3%酞丁胺二甲基亚砜搽剂。
(6)0.5%鬼臼毒素每天2次，连续3天，如能耐受可连用4～5天。如疣体未脱落，可隔周再用一个疗程。
(7)5%咪喹莫特霜可用于寻常疣的封包治疗或配合水杨酸治疗。
(8)1%西多福韦凝胶外用或2.5mg/ml皮损内注射对多种疣有效。
3.光动力治疗
系统或局部使用光敏剂氨基乙酰丙酸或氨基酮戊酸(ALA)，经光照射后引起局部细胞死亡，可治疗部分寻常疣。
4.物理治疗
冷冻治疗、电灼疗法、激光治疗、红外凝固治疗适用于数目少的寻常疣。
5.外科手术切除
术后易复发。