辅酶q10的副作用可能会导致胃部出现不适，从而会引起恶心、腹泻、心悸以及食欲不振的问题。服用药物治疗疾病需要在医生指导下来合理使用药物，在服药时最好选择在半小时后服药，能够提高药物的安全性，降低副作用的发生几率。
辅酶q10最常见的副作用是对胃肠组织的反应，每个患者的体质不同，肠道的承受能力不同，所以服用药物之后出现的不适症状以及不良反应也会存在一定差异，大部分的患者吃完这种药物之后会感到腹胀，腹部出现不适以及腹部有灼烧感，有的患者还会导致皮肤出现不适引起皮肤出现瘙痒以及过敏性红斑的问题。在服用药物治疗疾病之前，要做好相应的检查工作，做好相应的抗过敏测试，明确是否具备服用药物的条件，从而降低不良副作用的发生几率。
为了降低药物对胃肠道的刺激，在服用药物时最好选择在饭后半小时服用，能够起到保护胃黏膜的作用，可以防止胃酸分泌过多能够降低恶心、呕吐以及腹泻的出现。服药一周左右时间不良的副作用依然存在，需要及时停止服药。