燕窝虽营养价值高，但清理里面的毛却是相当费力的一件事，然而无论什么品种的燕窝，里面或多或少都有一些绒毛存在，而且燕窝毛非常细小，里面还经常掺杂着蛋壳、甲虫等等，如果清理不干净食用，就会有害身体健康。因此，想要吃到美味的燕窝，挑毛是一道很重要的工序。
浸水清洗挑毛法:
第一步:清水浸泡这种挑毛的方法，首先是将燕窝用清水浸泡2-4小时，中间每隔半小时或1小时换一次水。
第二步:冲洗燕窝燕窝浸透之后，放在网眼很小的过滤网内，一边用水冲洗，一边顺着纤维把燕窝撕成条状，比较容易冲去杂质，反复的多冲洗几次之后再捞起来。如果燕窝中的毛比较多，可以用一个较大较深的盆盛着燕窝，放在水龙头下面，开大水用力冲燕窝，燕窝深层的毛会被打上来，等燕窝沉下去后把水倒掉一半，就能把小毛滤去，多进行几次去毛效果是比较好的。
第三步:用镊子挑毛准备好一把镊子和一小碗比较干净的水，用镊子把燕窝表面以及内部剩余的燕毛夹起来，并在干净的水中蘸一下，将燕毛转移到水中去。
保持盏型挑毛法:
这种方法是燕窝需要保持盏型的情况下挑毛，不用泡发，分为干挑、湿挑。干挑干挑是不用碰水的，直接把燕毛挑出来就可以了。适合需要长期保存的燕窝，燕窝会容易湿度过大而发霉。燕窝中比较多毛的是燕窝中间支撑蛋只及小燕的纤细网状物即燕网，而且燕网中还可能有碎蛋壳，清理这部分时，可以将燕网撕下，然后再进行挑毛，用手指轻拍燕窝表面让蛋壳掉出。
湿挑第一步：泡水先将燕窝泡水，燕窝一变软就马上捞出，让燕窝保持完整的窝状，不要等泡散了再挑。
第二步：挑毛然后准备一个碗和镊子，装上清水，开始挑毛。用镊子把燕窝中的毛挑出然后放进清水碗即可。