恩替卡韦是漫性乙型肝炎抗病毒治疗中重要的药物之一，重要用于病毒复制活动性、红细胞转氨酶持续升高或肝脏组织学提示有活动占位性的乙型肝炎患者。其副作用重要常见于ALT升高、疲倦、眩晕、腹部不适、上腹部疼痛、头晕恶心想吐、肝区不适、肌疼、失眠和风疹等，这类副作用多见轻到中重度。此外，在恩替卡韦服药期限内不能私自撤药，如断药可出现病状加重的可能。如对恩替卡韦和其药物成分有皮肤过敏情况，应严禁应用。
恩替卡韦是治疗慢性乙肝的一种抗病毒药，副作用包括2个方面：第一是药物本身造成的不适症状，十分是一开始服用状况下比较明显，随着着治疗时间的提升，渐渐地减轻至显示，另一种是撤药后造成 的病状反弹。前一种重要包括头痛、疲惫、眩晕、头晕恶心想吐等，还可能影响肾功能、钙磷代谢，因此服用者需维护保养肾功能、钙磷等指标。后一种体现为撤药后病毒感染感染反弹引起，比较严重可能会造成 肝衰竭，因此，要锲而不舍可靠治疗，切忌随意撤药。
长久性吃恩替卡伟的患者可能会出现以下副作用：一、出现疲倦、头痛、头晕恶心想吐、皮疹等情况，一般水准都比较轻，不影响生活起居；二、出现睡眠障碍，有的人服用之后会难以入睡或者睡眠变浅、睡眠时间降低、很容易睡不着觉、睡眠质量较前有明显减少，撤药之后基本都能恢复正常；三、有可能出现乳酸酸中毒，比较常见于失代偿期肝硬化的患者。
一部分患者可能会出现肾功能异常，具体表现为肌酐升高，出现尿微量白蛋白、肾小管滤过率减少的具体表现。但是大体上恩替卡韦的副作用十分轻和十分少见，还是临床医学专业上十分功能强大的一线抗病毒药。