长期吃头孢的副作用可能会伴有肠胃道刺激、诱发过敏、诱发肝肾功能影响等，每个人的体质不同，所以产生的影响程度不同。
1、胃肠道刺激：头孢在吃了以后需要被胃肠道分解和吸收，可能会伴有胃肠黏膜刺激，长时间的用药，可能会伴有刺激性的胃肠道胀痛、恶心等不良影响。
2、诱发过敏：头孢在吃了以后也可能会诱发药物过敏，可能会引起过敏性鼻炎，容易诱发鼻塞、鼻痛、打喷嚏等，可能会诱发过敏性荨麻疹，会伴有肌肤红肿、瘙痒等危害。
3、诱发肝肾损伤：长期吃头孢以后需要通过肝脏和肾脏代谢的方式排出体外，可能会导致肝脏和肾脏细胞损伤，容易引起肝肾的代谢功能减弱。