阴茎上有小水泡有可能是出现了炎症感染或是出现了病毒性的感染，需要根据病因针对性治疗，有利于防止病情加重。
1、细菌性感染：有可能是感染了金黄色葡萄球菌或是链球菌等多种的原因，容易使局部的表皮出现发炎，从而会引起发红和肿胀以及疼痛严重时可能会导致生殖器的皮肤出现水泡和溃烂等多种的症状。可以使用红霉素软膏或是金霉素软膏涂抹治疗，有消炎的功效，可以使炎症逐渐消除和水泡消退，防止皮肤出现严重的损伤。
2、病毒性感染：一般是感染的带状疱疹病毒等原因，会导致阴茎皮肤出现有小水疱，还可能会引起疼痛和引起局部有烧灼感等多种症状。一般可以使用阿昔韦洛乳膏或者利巴韦林药物治疗，可以起到抗病毒的作用，有利于局部的水泡消除和皮肤逐渐的修复。
治疗期间通常需要做好皮肤的护理工作，穿纯棉透气性较好内裤，有利于防止皮肤受到摩擦，还可以防止皮肤出现破损的后果，短时间之内并不可以性生活，有可能会导致病情的恢复受到干扰，还要避免抽烟喝酒或吃刺激性的食物。