跑步肩膀疼可能是由于受凉、过度劳累、肩周炎等原因引起的，可以在医生的指导下进行治疗。
1、受凉：由于患者在跑步时肩膀部位受凉或者受风，可能会刺激局部血管收缩，从而出现疼痛的现象，建议患者可以适当热敷肩膀部位，能够缓解不适症状。
2、过度劳累：由于患者长时间跑步或者长时间从事重体力劳动，可能导致肩膀负重过多造成肌肉痉挛的现象，建议患者可以适当按摩肩膀部位，能够缓解肌肉不适。
3、肩周炎：大多是由于肩关节退行性病变或者受到外伤的原因引起的，一般可以在医生的指导下使用塞来昔布、布洛芬等药物进行治疗。
除此之外，也可能是由于颈椎病等原因导致的，建议患者及时去医院就诊，以免药物病情。