健儿药丸副作用一般是不大，在医生指导下规范使用并不会出现明显副作用，但是如果一次性使用药物剂量比较大，就有可能会导致肠胃不适、引起腹泻、皮肤过敏等等。
1、肠胃不适：健儿药丸属于一种比较常见中成药，使用以后可以用来治疗小儿食积、乳积所导致腹胀、腹痛等症状。小儿肠胃功能相对来说是比较虚弱，如果一次性吃得过多，就有可能会导致肠胃负担加重，引起肠胃不适。
2、引起腹泻：如果在使用药物以后，选择剂量比较大，就有可能会导致患者出现腹泻症状。
3、皮肤过敏：少数患者在服用药物以后，就有可能会导致皮肤出现过敏反应，引起皮肤表面出现风团等等。