沙眼衣原体阳性怀孕了可以通过一般治疗、药物治疗、终止妊娠等方法改善。
1、一般治疗：沙眼衣原体阳性说明感染了沙眼衣原体，孕妇感染以后需要多注意个人卫生，定期到医院进行复查，了解胎儿发育情况和病情的恢复情。
2、药物治疗：如果怀孕以后感染沙眼衣原体以后病情比较轻，可以在医生指导下服用，对胎儿影响比较小，比如红霉素胶囊、克林霉素片、阿奇霉素片等药物治疗。
3、终止妊娠：如果在怀孕早期发生了沙眼衣原体感染，而且症状比较严重，需要服用药物治疗，可能会影响到胎儿的发育，如果孕妇担心传染给胎儿或担心胎儿有影响可以根据自己的意愿终止妊娠。
除了以上方法，平时多注意增加营养，有助于帮助病情恢复。