早上醒来脸肿眼睛肿可能是喝水过多、过敏、熬夜等原因导致的。需要到医院检查确定原因，对症治疗。
1、喝水过多：如果睡觉前喝了过多的水，会加重肾脏负担，容易出现身体浮肿的情况，可能会导致脸肿眼睛肿。一般不需要特殊治疗，能够自行恢复。
2、过敏：如果患者早上用了成分比较复杂的化妆品，有可能会产生皮肤过敏，出现脸肿眼睛肿的情况，可以遵医嘱使用盐酸西替利嗪片、氯雷他定片、马来酸氯苯那敏片的药物治疗。
3、熬夜：如果患者长期作息不规律，经常熬夜，可能会导致肾部受损，产生代谢障碍，容易出现脸肿眼睛肿的情况。可以通过调整作息，保持充足的睡眠，缓解症状。
除了以上常见的原因外，还有可能是睑腺炎导致的，具体的原因可以到医院就诊检查，针对性治疗。