药流后有褐色分泌物的原因可能是正常现象、炎症感染、子宫复旧不全等。
1、正常现象：正常现象主要是因为药物流产手术以后会导致阴道出血，而且出血的时间大概在7天左右，在出血的末期也会引起褐色的分泌物。
2、炎症感染：炎症感染也在做完药物流产手术以后没有做好阴道部位的卫生，这样就会导致细菌滋生，甚至还会引起宫腔部位存在炎症，需要在医生的指导下口服阿莫西林胶囊、头孢克洛胶囊、青霉素V钾颗粒等。
3、子宫复旧不全：子宫复旧不全主要是针对在做完药物流产手术以后过早的性生活，这样就会导致子宫复旧不全，甚至还会存在褐色分泌物。
除了以上比较常见的原因以外，还有可能是因为毛细血管闭合不全导致的，需要到正规的医院妇科做相关的检查，然后针对性的治疗。