肺部真菌感染的话在治疗问题上当然是应该注重的，首先需要注意提高机体的免疫能力，及时的抢救，而且也要注意正确的使用一些抗真菌感染的药物，但是对于药物的使用应该注意听从医生的建议。
(一)提高机体免疫抢救能力如纠正低蛋白血症改善营养状态纠正贫血和粒细胞减少等。
(二)抗真菌药物治疗地区由于真菌细胞和人类细胞相似，因此抗真菌药物不良反应较多。常用的抗真菌药物有以下几种。两性霉素B、三唑类(如氟康唑伊、曲康唑伏、立康唑)葡聚糖合成酶抑制剂、脂质体制霉菌素。
(三)肺真菌感染常见的为念珠菌病、曲霉病、隐球菌病。少见的有毛霉菌病组织胞浆菌病球孢子菌病。
(四)预防加强医院管理、控制广谱抗生素和糖皮质激素的使用、重症监护病房的空气净化、呼吸治疗编委装置的消毒、化疗患者的层流病房等。可大大降低肺真菌病的发生。对于那些经积极抗生素治疗部委症状和X线胸片无好转，应高度警惕真菌感染，以期早期一项诊断治疗。
预防：
1.避免诱因
避免受凉、淋雨、过度疲劳;避免与感冒患者接触，避免脏手接触口、眼、鼻。年老体弱易感者更应注意防护，上呼吸道感染流行时应戴口罩，避免在人多的公共场合出入。
2.增强体质
坚持适度有规律的户外运动，提高机体免疫力与耐寒能力是预防本病的主要方法。
3.免疫调节药物和疫苗
对于经常、反复发生本病以及老年免疫力低下的患者，可酌情应用免疫增强剂。目前除流感病毒外，尚没有针对其他病毒的疫苗。