吃治疗幽门螺杆菌药副作用有可能会引起腹泻、过敏、中枢神经不适等多种症状，多数会存在个体差异。
1、腹泻：患者使用幽门螺杆菌药物期间里面抗生素有可能会导致肠道受到刺激，可能会引起腹泻副作用，容易引起拉肚子等不良副作用。
2、过敏：治疗幽门螺杆菌需要使用抗生素和抑制胃酸分泌以及保护胃黏膜等药物，对于药物里面成分敏感人群有可能会出现过敏副作用，可能会引起皮疹和皮肤瘙痒等症状。
3、中枢神经不适：药物使用期间患者有可能会导致中枢神经受到刺激，有可能会使患者身体出现头晕和头痛等多种副作用。
除以上副作用以外，还可能会引起便秘等多种症状，需要针对性改善和治疗。