头孢跟阿莫西林的区别主要是药物的化学结构，而且适应症或者是注意事项不同，最好到当地正规医院做进一步的检查，然后再根据个人的病情选择合适的用药方案，不能够盲目的使用，以免使用药物不当影响到个人的病情恢复。
1、药物化学结构：头孢是属于一种头孢菌素类的药物，而阿莫西林是属于一种青霉素类的药物，头孢和阿莫西林的化学结构都含有β-内酰胺基团。
2、适应症：头孢和阿莫西林对于革兰氏阳菌能够起到很好的改善效果，但是不能够达到杀灭支原体或者是衣原体的作用。头孢药物是属于一个种类，包含的是比较多的，可用于多种病原菌的感染，阿莫西林不可用于铜绿假单胞菌引起的感染，但是头孢对于这种病原菌是有效果的。
3、注意事项：阿莫西林是属于一种青霉素类的药物，在使用之前需要做皮试，主要是判断是否对这种药物的成分产生过。而服用头孢类药物期间是不可以饮酒的，否则会出现双硫仑反应，甚至还会危及患者的生命。
在用药之前一定要详细的阅读用药说明书，了解药物的使用方法或者是注意事项，有效减少用药的风险性。