口腔扁桃体窝长疙瘩可能是长时间吃辛辣刺激性食物，也不排除是受到病毒感染引起的，或者是有淋巴结发炎，都有可能会引起扁桃体部位长疙瘩有疼痛感，可以去正规医院做咽喉镜检查。
1、吃刺激性食物：长时间吃辛辣刺激性食物，不喝水很容易出现上火症状，使咽喉部位有疼痛感，伴随着扁桃体发炎出现疙瘩，可以多喝温开水加快体内代谢功能，如果出现扁桃体疼痛特别严重，避免病情进一步发展，可以遵从医嘱口服清开灵是中成药物，具有清热解毒的效果，能够改善咽喉部位出现疼痛感。
2、病毒感染：病毒感染可能是外部的时候感染轮状病毒，也不排除是自身抵抗力下降，特别严重受到传染等原因引起的，会使病毒细胞在身体内繁殖，使扁桃体部位出现疼痛感，有肿大现象，可以遵从医嘱口服蒲地蓝口服液和板蓝根，能够有效起到消炎和抗病毒作用，改善咽喉部位出现的疼痛感。
3、淋巴结发炎：淋巴结发炎可能是受到细菌感染引起的，通常是金黄色葡萄糖菌最为常见，可以遵从医嘱口服阿莫西林胶囊。