长期用磁疗床垫一般没有太大的危害，但是身体存在一些异常症状或者疾病的情况下，要避免睡磁疗床垫。磁疗床垫属于是一种养生保健的床垫，在使用的过程中还没有发现有明显的副作用。
磁疗床垫里面具有磁性物质，如果体内存在金属异物，比如做了骨折手术之后，体内有钢板固定，如果长时间睡磁疗床垫的情况下，不利于骨骼的恢复以及愈合，如果是体内植入了心脏起搏器，可能会受到磁场的干扰，影响到起搏器的正常工作严重的时候还会引起心脏骤停，危害到身体健康。如果是一些特殊人群，包括心脏以及肝肾疾病的人，避免使用磁疗床垫，如果是体质极度虚弱以及发高烧的人也避免使用磁疗床垫，可能会引起病情加重。磁疗床垫里面有大量的磁石，可以起到宁静安神的作用，提高睡眠质量，但是磁石性寒，如果体寒以及老年人长时间睡，可能会引起体质偏寒症状加重。
在日常生活中还可以多做一些体育运动，能增强自身体质，在生活中需要选择硬板床休息，避免经常睡一些比较松软的床。