机遇病原菌又称之为条件致病菌，就是指通常条件下对人不发病，在一些特殊条件下能对身体发病的病菌。机遇发病的发病标准包含：1、肠道菌群失调，一切正常有益菌与寄主中间，一切正常有益菌中间存有均衡关联。假如这类均衡被摆脱，机遇病原菌就可发现异常繁衍与发病力提高。2、当机体免疫功能减少时，一切正常有益菌进到身体组织或血液循环系统后可发病。3、一些病菌离去一切正常寄住位置，进到别的位置生长发育繁育并发病。机遇病原菌的发病标准一般只包括以上三种。
艾滋病患者进到艾滋病期以后，因为免疫功能降低很容易产生机遇性感染，在其中最普遍、最广为人知的便是肺孢子菌肺炎。肺孢子菌归属于一种细菌，它感染艾滋病患者以后能够造成 病人出現慢性咳嗽、发热，及其呼吸不畅、血氧分压降低，比较严重的病人还能够进度到呼吸衰竭，病人会由于持续的呼吸不畅造成 全身多内脏器官衰退，乃至能够造成身亡。除开肺孢子菌肺炎以外，病人还能够出現隐球菌性脑膜炎、白念珠菌性食管炎、带状疱疹、巨细胞性视网膜炎等。除开感染以外，病人还能够继发性恶变肿瘤，比如恶性淋巴瘤、卡波西肉瘤等。
实际上人是日常生活在一个填满病菌，病毒感染等微生物菌种的自然环境中，包含口腔，肠胃等位置，都带有很多病菌，病毒感染，这种微生物菌种都可能变成病原菌。当人体免疫力强过病菌发病力时，身体能够和他们和睦相处，使这种微生物菌种变成定植菌，肠胃中的病菌乃至能够协助身体消化吸收食材，变成益生菌粉。
可是，当机体免疫能力出現降低，身体和病菌中间的均衡会遭受毁坏，使本来的定植菌，益生菌粉变成病原菌，比如肠胃定植菌在长期性应用抗生素后，会变成二重感染的病原菌，口腔时间常数的滴虫也可能在免疫力低下时变成口腔念珠菌病的病原菌。