肛门上部疼痛可能是因为便秘、三叉神经痛、痔疮的原因导致的。
1、便秘：便秘是由于大便出现了关节，这样就会影响到正常的排便，甚至还会引起下腹部出现疼痛，需要通过适当运动或者是调理饮食的方法来改善。
2、三叉神经痛：三叉神经痛是属于一种脑部神经疾病，但是脑部神经会对全身的神经造成刺激，需要在医生的指导下口服卡马西平片、甲钴胺片、苯妥英钠片等。
3、痔疮：痔疮是由于直肠或者是肛管下端出现了静脉充血，需要在医生的指导下选择手术的方法来达到治疗的效果，这样治疗会比较彻底。
除了以上比较常见的原因以外，还有可能是因为肛门肌肉纤维炎症引起的，需要到正规的医院肛肠科做相关的检查，然后针对性的治疗。